2022年3月16日,廣東省人民醫(yī)院檢驗科顧兵教授團隊聯(lián)合華南理工大學張雷教授團隊在中科院1區(qū)感染領域權(quán)威雜志Emerging Microbes & Infections發(fā)表了題為“RT-LAMP assay for rapid detection of the R203M mutation in SARS-CoV-2 Delta variant”的論文(doi:10.1080/22221751.2022.2054368),
本研究開發(fā)了一種基于RT-LAMP鑒定單堿基突變水平的檢測方法,針對SARS-CoV-2N基因的保守區(qū)域、Delta特異突變R203M區(qū)域設計了2對特異性引物(conserved primer set 和R203 primer set),在CqR203M/ Cq conserved閾值為1.80時,可實現(xiàn)新冠病毒Delta突變株及野生株的快速檢測及區(qū)分,并進行了臨床驗證,分型準確率達到100%。
圖1. RT-LAMP法對新冠Delta典型突變位點檢測方法的建立
該方法實現(xiàn)1小時左右對Delta變異株的鑒定和SARS-CoV-2感染的實時監(jiān)測,常規(guī)的熒光定量PCR檢測平臺即可開展,有望為COVID-19可疑患者的快速分流及Delta株的精準分型提供有力手段。
圖2.Cq-ratio based RT-LAMP技術(shù)對新冠臨床樣本的檢測和分型
顧兵教授和李杉教授為論文的共同通訊作者,楊佳寧和胡雪姣博士為共同第一作者,該項研究得到國家自然科學基金(82072380, 81871734, 82002236)、國家藥監(jiān)局血液制品質(zhì)量控制重點實驗室(KF2021009)、國家重點研發(fā)項目(2017YFC160120,2018ZX09201-02)的支持。
(文:胡雪姣;圖:趙云虎;審閱:顧兵;通訊員:郝黎、張藍溪、靳婷)
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